En betydande del av museet samlingar finns i Malmska gården. I Malmska gården kan man bekanta sig med stadens sjöfartshistoria och Malmska handelshusets historia. I utställningen visas bland annat tidstypiska interiörer från senare delen av 1800-talet, skeppsporträtt och fartygsmodeller.
I Malmska gården visas även en utställning om stadens historia och här finns också en museibutik som kan besökas under museets öppettider.
Den så kallade lilla byggnaden är ett typiskt bostadshus från slutet av 1700-talet. Byggnaden är uppförd i stock och rappad. I byggnaden finns Veteranernas samling. Den är öppen enligt överrenskommelse.
En av ekonomibyggnaderna inrymmer en lanthandel och en arbetarbostad från 1950-talet samt en gammal damfrisering.
Dessutom finns det en bondstuga och en tackelkammare.
I Malmska gården finns också Museibutiken som är öppen enligt museets öppettider.